Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1SQ13698 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms