Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CDH18Q13634 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CDH18Q13634 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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