Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSLNQ13421 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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