Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF1Q13351 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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