Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5R2Q13319 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5R2Q13319 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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