Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.436e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.56e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARL2-206ENST00000533729 795 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.366e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.437e-13■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.942e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.99e-24■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-24■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.139e-24■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 TMA7-202ENST00000477624 619 ntTSL 1 (best)25.94■■□□□ 1.741e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 TMA7-203ENST00000479126 688 ntTSL 224.43■■□□□ 1.51e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.27e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.357e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 222.38■■□□□ 1.177e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 218.74■□□□□ 0.597e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 315.2■□□□□ 0.027e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 VKORC1-207ENST00000472468 461 ntTSL 221.83■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 VKORC1-208ENST00000498155 870 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.144e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.711e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.171e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 214.64□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 530.73■■■□□ 2.512e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.412e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 218.66■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DCUN1D5-203ENST00000527260 808 ntTSL 57.21□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.616e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.416e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 314.1□□□□□ -0.156e-67■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.973e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.783e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.763e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 PSRC1-212ENST00000492431 1870 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-23■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 215.1■□□□□ 0.011e-23■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.251e-23■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 211.71□□□□□ -0.541e-23■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.581e-23■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 221.89■■□□□ 1.13e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RNF40-212ENST00000602784 991 ntTSL 316.4■□□□□ 0.223e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.573e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 521.06■□□□□ 0.963e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 57.47□□□□□ -1.213e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 MRPS6-203ENST00000482679 1956 ntTSL 26.49□□□□□ -1.373e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 MRPS6-204ENST00000483977 3934 ntTSL 1 (best)4.94□□□□□ -1.623e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-14■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 25.38□□□□□ -1.554e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 26.39□□□□□ -1.391e-10■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 321.34■■□□□ 1.014e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 220.75■□□□□ 0.914e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 DYNC1LI1-208ENST00000481915 4791 ntTSL 24.95□□□□□ -1.623e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.059e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.657e-9■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PRMT1-209ENST00000527866 968 ntTSL 220.86■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 AP2S1-206ENST00000598027 355 ntTSL 27.99□□□□□ -1.135e-16■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 MRPL21-207ENST00000565125 2283 ntTSL 518.67■□□□□ 0.581e-13■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 MRPL21-201ENST00000362034 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-13■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-13■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-13■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.251e-37■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.476e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.566e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.416e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.376e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 224.86■■□□□ 1.572e-10■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.422e-10■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.352e-10■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 222.18■■□□□ 1.142e-10■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-10■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 514.35□□□□□ -0.112e-10■■■■□ 19.3
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