Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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