Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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