Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms