Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC16Q13042 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms