Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FOXD4Q12950 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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FOXD4Q12950 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FOXD4Q12950 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FOXD4Q12950 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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