Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms