Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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GTF3C1Q12789 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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GTF3C1Q12789 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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GTF3C1Q12789 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C1Q12789 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms