Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCAPQ12770 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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