Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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