Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms