Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms