Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ABCC8Q09428 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC8Q09428 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms