Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP4Q09028 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms