Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms