Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP4F3Q08477 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms