Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms