Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms