Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms