Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms