Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms