Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms