Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB1Q02818 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms