Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms