Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms