Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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