Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELF3P78545 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELF3P78545 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF3P78545 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms