Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRX1P78414 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRX1P78414 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms