Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTG1P63261 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms