Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOBP62745 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOBP62745 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOBP62745 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms