Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFA3P59666 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms