Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms