Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms