Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms