Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRAP54198 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRAP54198 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRAP54198 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIRAP54198 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRAP54198 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIRAP54198 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIRAP54198 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIRAP54198 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms