Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB28P51157 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms