Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITPNBP48739 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms