Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTF4P34130 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTF4P34130 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms