Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DSG3P32926 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms