Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms