Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA5P30532 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms