Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms