Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD38P28907 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD38P28907 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD38P28907 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD38P28907 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms