Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms