Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPREP23469 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms